故事发生在1948年，特别调查局要员俞北平（陈建斌 饰）被上级调往青城，奉命调查发生在那里的命案，可实际上，俞北平的真实身份正遭到上级的调查和怀疑，他时时刻刻都处于危险之中。在青城，俞北平遇见了名为林莎（齐溪 饰）的女子，身为美军中尉的她，其真实身份其实是俞北平失散多年的女儿。　　俞北平还有一个

民国年间，上海大元银行遭遇四名匪徒抢劫，银行背后的老板燕大帅下令掘地三尺也要将钱追回。此时，在街头卖艺糊口的龙一金小螃蟹兄妹和神秘的女侦探艾琳遇到了奄奄一息的银行劫匪铁虎。铁虎声称被自己人出卖，临终前拿出一把钥匙并告诉三人去寻找胡家戏班班主。三人为求赏金，决定携手合作，而燕大帅及其子燕少的追杀，胡班

明朝末年，皇帝昏庸，阉党专权。大太监魏忠贤把持朝政结党营私，培养了三位武艺高强的女刺客冷、凌、影为其效命。锦衣卫指挥使欧阳寒为克制实力强大的东厂，亲自出手获得了扳倒魏忠贤的密函。三位女刺客奉命前去刺杀欧阳寒并夺回密函，岂料任务遭逢意外，刺客凌伪装成柔弱女子混入欧阳寒藏身的状元客栈，却遇到了曾经青梅竹

《大清神捕》将背景设置在十九世纪中叶，鸦片战争后中国近代史正式拉开帷幕，时值清廷内忧外患，而此时的南方阳城，一起耸人听闻的剥皮案，更是引起各方势力的蠢蠢欲动。阳城县热血捕快白雪晴的查案之路被县长何玉庭阻拦，却意外和暗访的四阿哥发现人皮案的后面涉及到关系着大清命运的阎王宝藏，两人寻宝之路正式展开……